В реставрационных мастерских музея проводится реставрация археологических предметов из органических материалов, таких как кость, кожа, ткань (фрагменты изделий), береста.
Фонды музея богаты археологическими коллекциями, состоящими из предметов поступавших в музей в результате археологических раскопок на протяжении всего XX в. На средневековых археологических памятниках Пермского края неплохо сохраняются изделия из кости – наконечники стрел, гребни. А на памятниках археологии в городах Пермского края, датированных XVIII-XIX вв. хорошо сохраняются изделия из бересты, кожи, дерева. В современной реставрационной практике реставрация археологических изделий сводится к очистке от наслоений и консервации материала. А в реставрации археологических предметов из пластичных органических материалов таких как кожа и береста возможно удаление деформаций и придание первоначальной формы предмету